Les contamination dans la culture de champignons - Le Jardin Mycélia

Les contamination dans la culture de champignons

Titre de l'article : Common contamination in mushroom cultivation ?

Lien de l'article https://northspore.com/blogs/the-black-trumpet/common-contamination-in-mushroom-cultivation

Publication : Will Broussard le 01/02/2024 pour NorthSpore

Que vous soyez un amateur ou un cultivateur de champignons, la principale cause d'échec de la récolte est la contamination. La contamination, désigne tout élément présent dans votre substrat ou dans le mycélium qui impacte négativement votre culture, et peut inclure des bactéries, des moisissures et des parasites animaux.

Dans cet article, nous passerons en revue les sources courantes de contamination dans la culture des champignons, mettrons en lumière cinq contaminants courants et offrirons des conseils pour réduire la contamination dans vos activités de culture future. Vous saurez ainsi si vos champignons sont contaminés ou non, comment cela aurait pu se produire et comment empêcher que cela ne se reproduise à l'avenir !

Quels sont les signes de base de la contamination ? Avant d'entrer dans le vif du sujet, voici une liste des signes de base de la contamination dans la culture des champignons :

• Décoloration : Changements de couleur, tels que des taches jaunes ou brunes sur la surface des champignons ou du milieu de croissance.

• Odeurs anormales : Une forte odeur nauséabonde émanant des récipients de culture ou du milieu de croissance.

• Croissance anormale : Champignons qui poussent de manière anormale, comme ceux qui sont difformes ou rabougris.

• Présence de moisissures : Apparition de moisissures, telles que des croissances blanches ou bleu-vert sur la surface des champignons ou du milieu de croissance.

• Présence d'insectes : Présence d'insectes, tels que des mouches ou des acariens, sur le substrat ou les corps fruitiers.

Si vous remarquez l'un de ces signes, il est important d'agir immédiatement pour éviter toute contamination supplémentaire. Cela peut impliquer d'abandonner vos contenants, de désinfecter la zone de culture ou d'ajuster les conditions de croissance pour améliorer la santé globale de votre culture.

La technique stérile, ou "tek", désigne le processus de maintien d'un environnement propre pendant toute la durée du processus de culture. Utilisez un équipement stérilisé, cultivez uniquement sur des substrats stérilisés et maintenez un environnement propre et contrôlé en tout temps.

  • Contamination par voie aérienne: Les champignons se reproduisent par des spores, qui sont des cellules microscopiques libérées à partir du champignon et dispersées le plus souvent dans l'air. Elles peuvent rester viables pendant de longues périodes, dans certains cas indéfiniment. Le meilleur moyen de réduire les spores indésirables et toute autre contamination par voie aérienne dans votre espace de travail est d'utiliser une hotte à flux laminaire, qui est un banc de travail comprenant un tampon filtrant, un ventilateur et un filtre HEPA (air particules à haute efficacité) intégré. 
  • Contamination par les substrats: Les substrats de champignons sont le lieu de reproduction parfait pour les microbes indésirables. S'ils ne sont pas correctement traités par pasteurisation ou stérilisation, la contamination entraînera des récoltes perdues.  Différentes espèces préfèrent différents traitements, la première option inclue la pasteurisation et la deuxième la stérilisation en utilisant un stérilisateur sous pression.
  • Contamination d'origine humaine: Le corps humain est la plus grande source de contamination dans la culture des champignons. Les mains et les vêtements humains contiennent beaucoup de bactéries et de spores qui peuvent ruiner une récolte. Avant de commencer à travailler, utilisez un désinfectant pour les mains par exemple. 

 

Alors que le mycélium est généralement blanc et filamentaire ou cotonneux, la contamination prend généralement la forme de taches ou de décolorations vertes, bleues, grises ou noires dans votre substrat. Gardez à l'esprit que les taches bleues sur certains types de mycélium peuvent être simplement des contusions naturelles et non une contamination, surtout si le substrat appuie le mycélium contre du verre ou du plastique. Une astuce simple pour déterminer si votre décoloration est contaminée ou non est de passer doucement un coton-tige dessus, car la contamination se transférera sur le coton-tige tandis que les contusions ne le feront pas. 

 Voici cinq des contaminants les plus courants rencontrés dans la culture des champignons:

  1. Trichoderma: Le Trichoderma harzianum est fréquemment observé dans la culture des champignons. Il produit des taches vertes qui peut recouvrir rapidement les substrats, se distinguant par son apparence duveteuse. Cette contamination peut survenir à n'importe quel stade de la culture et peut causer des dommages importants en se nourrissant des espèces cultivées. Pour contrer le Trichoderma, il est essentiel d'isoler et d'éliminer immédiatement les substrats contaminés, en désinfectant les outils affectés. La prévention implique une ventilation adéquate, un environnement propre et une surveillance constante pour détecter les signes de contamination. Malheureusement, une fois détecté, le contrôle du Trichoderma est souvent difficile, nécessitant parfois de recommencer la culture depuis le début.
  1. Moisissure du pain orange: La moisissure du pain orange, la moisissure rouge du pain ou la moisissure rose sont des noms alternatifs pour Neurospora crassa, cette moisissure orange néon peut causer des ravages dans votre exploitation en seulement 8 à 12 heures. Elle apparaît d'abord comme un flocon orange-blanc mais se développe rapidement en une tache poudreuse orange vif. Une fois trouvée, contenir la source en la scellant dans un sac en plastique et la jeter immédiatement, en veillant à ne pas perturber la moisissure car elle libérera un nuage fin de spores orange dans l'air qui peuvent se propager rapidement. Après la disposition, désinfectez la zone affectée et inspectez votre espace de travail pour trouver la source, qui pourrait inclure des marc de café jetés, du compost ou du bois humide non traité.

  2. Bacillus spp. (Contamination bactérienne): La forme la plus courante de contamination bactérienne dans la culture des champignons est connue sous le nom de "point humide" ou "pourriture acide". Elle se caractérise par un limon gris terne avec une odeur de moisi qui semble excessivement humide ou visqueux et se forme souvent en taches non colonisées le long du fond des bocaux de grains. Leurs structures reproductrices sont appelées endospores, qui sont résistantes à la chaleur, ce qui signifie qu'elles survivront au processus de stérilisation. Pour les prévenir, les grains peuvent être trempés pendant 12 à 24 heures à température ambiante avant la stérilisation, permettant aux endospores présentes dans le grain de germer et d'être éliminées pendant la stérilisation. Si la contamination est rencontrée, il est possible de la séparer du reste des grains mycélisés (tant que la tache est petite et confinée à une zone) en enlevant physiquement la tache à l'aide d'une cuillère préalablement désinfectée à l'alcool ou stérilisée par flamme. Cela peut également se produire dans un monotub avec une tache isolée de contamination où l'exsudat de champignon a transformé la zone affectée, jaune, indiquant une tentative par le champignon de lutter contre la bactérie rivale.

  1. Moisissure d'araignée: La moisissure d'araignée (Hypomyces rosellus) est une autre espèce de champignons nuisibles que l'on peut rencontrer dans la culture des champignons, surtout dans des environnements avec de l'air stagnant, très peu d'oxygène et une humidité élevée tels que les bocaux de grains et les monotubs. Il peut être difficile à détecter en raison de son apparence grise, blanche et duveteuse qui ressemble au mycélium, mais son motif de croissance est plus tridimensionnel, semblant flotter au-dessus du substrat en touffes blanches. De plus, ce moisissure se forme souvent dans les derniers jours d'incubation, lorsque les substrats sont entièrement colonisés juste avant la fructification. La moisissure d'araignée se propage rapidement : une petite tache de la taille d'un centime peut se développer pour couvrir un bocal ou un monotub entier en 24 à 48 heures. Les cultivateurs peuvent prévenir la moisissure d'araignée en abaissant l'humidité dans leurs chambres de culture et leurs monotubs, ce qui peut être accompli en faisant attention à l'hydratation du substrat et en améliorant l'échange d'air frais. Après le trempage d'un papier essuie-tout dans de l'eau oxygénée et le placer sur la zone affectée pour contrôler les futures contaminations par la moisissure d'araignée.
  1. Moisissure du pain noir: Également connue sous le nom de moisissure en tête d'épingle, la moisissure du pain noir (Rhizopus stolonifer) est un contaminant de champignons courant dans le sol et l'air et est l'une des premières moisissures à apparaître sur le pain rassis. Ce champignon à croissance rapide a un mycélium dense qui est d'abord blanc et devient gris puis prend une apparence noire. Similaire à la moisissure d'araignée, la moisissure du pain noir est duveteuse mais développe de petits points noirs à l'extrémité de son mycélium où ses spores sont produites. La pulvérisation d'eau oxygénée peut aider à contenir la propagation précoce de la plupart des moisissures, y compris celle-ci, mais une fois que la moisissure avance au stade où elle est facilement identifiable, il peut être trop tard pour la culture. À ce stade, le meilleur moyen de traiter avec elle est de l'abandonner et de recommencer.

Les cultivateurs de champignons rencontrent tous tôt ou tard la contamination, alors il est bien d'apprendre à identifier les contaminants courants et comment développer une technique stérilisation rigoureuse. 

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